इलाहाबाद चुंबकीय वेधशाला की स्थापना वर्ष 2007 में भा.भू.सं. के अनुसंधान केन्द्र डॉ. के.एस. कृष्णन भू-चुंबकीय अनुसंधान प्रयोगशाला परिसर में की गई थी। इस वेधशाला का मुख्य उद्देश्य Sq धारा प्रणाली में रेखांशीय अंतर को समझने के लिए शिलांग के लगभग समान अक्षांश पर भारतीय रेखांश को समाहित करना है। यह हिमालयी क्षेत्र में किए गए भूभौतिकीय सर्वेक्षण के लिए आधार स्टेशन के रूप में भी कार्य करता है। इस वेधशाला में निरंतर मापन निलंबित कर दिए गए हैं क्योंकि संरचना प्रतिकूल मौसम की स्थिति से प्रभावित हुई है। भीषण जलवायु परिस्थितियों को ध्यान में रखते हुए, चुंबकत्वमापी की संरचनात्मक सहायक सुविधाओं के पुनर्निर्माण के प्रयास जारी हैं।